Je, Tofauti ya Omicron ya COVID-19 inaweza kuwa imetokea?

Moja ya kipengele kisicho cha kawaida na cha kuvutia zaidi cha lahaja ya Omicron iliyobadilishwa sana ni kwamba ilipata mabadiliko yote kwa mlipuko mmoja katika muda mfupi sana. Kiwango cha mabadiliko ni kikubwa sana hivi kwamba baadhi ya watu wanafikiri inaweza kuwa aina mpya ya virusi vya corona (SARS-CoV-3?). Je, kiwango cha juu kama hicho cha mabadiliko kinaweza kuwa kimetokea kwa muda gani? Wengine wanabisha kuwa Omicron inaweza kuwa imetokana na mgonjwa aliyekandamizwa kinga ya mwili na maambukizo sugu kama vile VVU/UKIMWI. Au, inaweza kuibuka katika wimbi la sasa la Uropa ambalo limeshuhudia viwango vya juu sana vya maambukizi? Au, inaweza kuhusishwa na utafiti fulani wa Gain-of function (GoF) au kitu kingine chochote? Nani anafaidika? Haiwezekani kuteka hitimisho lolote katika hatua hii. Hata hivyo, makala hii inajaribu kutoa mwanga juu ya vipimo mbalimbali vinavyohusishwa na jambo hilo.  

Lahaja mpya ya COVID-19 iliyoripotiwa hivi karibuni kutoka Afrika Kusini tarehe 25^th Novemba 2021 imeenea katika nchi kadhaa duniani ambazo ni Uingereza, Kanada, Japan, Australia, Austria, Hongkong, Israel, Hispania, Ubelgiji, Denmark na Ureno. Hii imeteuliwa kama lahaja mpya ya wasiwasi (VOC) na WHO na kutajwa omicron. Omicron ina sifa ya mabadiliko 30 ya amino asidi, kufuta tatu ndogo na kuingizwa moja ndogo katika protini ya spike ikilinganishwa na virusi vya awali.¹. Walakini, kulingana na viwango vya mabadiliko² ya virusi vya RNA, haiwezekani kuendeleza mabadiliko 30 pamoja na usiku mmoja. Itachukua angalau miezi 3 hadi 5 kutoa mabadiliko 6 katika genome ya 30kb ya SARS-CoV-2 kulingana na kiwango cha mabadiliko ambacho virusi hupitia kawaida.² juu ya uhamishaji kutoka kwa mwenyeji hadi mwenyeji. Kwa hesabu hii ingechukua muda wa miezi 15 - 25 kwa kitu kama Omicron kuibuka, ikibeba mabadiliko 30. Walakini, ulimwengu haujaona mabadiliko haya ya polepole yakiongezeka kwa muda uliotajwa. Inasemekana kuwa lahaja hii ilitokana na maambukizo sugu ya mgonjwa asiye na kinga dhaifu, yamkini mgonjwa wa VVU/UKIMWI ambaye hajatibiwa. Kulingana na kiwango cha mabadiliko, inapaswa kuainishwa kama aina mpya ya virusi (SARS-CoV-3 inaweza kuwa). Hata hivyo, idadi ya mabadiliko yaliyopo inaweza kuwa dalili ya uambukizaji wake wa juu kuliko vibadala vingine. Hata hivyo, tafiti zaidi zinahitajika ili kuthibitisha hili. 

Wiki chache zijazo ni muhimu ili kubaini uambukizaji wa lahaja mpya na ukali wa ugonjwa unaosababisha. Hadi sasa, kesi zote zimekuwa nyepesi na zisizo na dalili na habari njema ni kwamba hakujawa na vifo. Tunahitaji pia kutathmini ni kwa kiwango gani kibadala kipya kinaweza kuepuka ulinzi wa kinga unaotolewa na chanjo za sasa. Hili litaturuhusu kuamua ni muda gani tunaweza kuendelea na chanjo za sasa kabla ya kuziunda kwa kibadala kipya. Pfizer na Moderna tayari wamechukua hatua kuelekea kurekebisha chanjo zao. Walakini, swali linalokuja bado linabaki juu ya asili ya lahaja hii. Inaaminika kuwa lahaja ya Omicron inaweza kuwa imeibuka katika wimbi la sasa la matukio ya juu zaidi ya kesi huko Uropa mapema zaidi, lakini iliripotiwa na mamlaka ya Afrika Kusini hivi karibuni (kulingana na mpangilio wa jenomu). Walakini, hii inaweza isiwe hivyo kwani wimbi la sasa limekuwepo kwa miezi 4-5 iliyopita na kulingana na viwango vya mabadiliko, inapaswa kuwa imesababisha mabadiliko yasiyozidi 5-6. 

Au ilikuwa Omicron, bidhaa ya Utafiti wa Faida ya Kazi (GoF) inayoongoza kwa maendeleo ya vimelea vya magonjwa vinavyoweza kutokea (PPPs)^3,4. Faida ya utafiti wa utendakazi inarejelea majaribio ambapo pathojeni (katika kesi hii SARS-CoV-2), hupata uwezo wa kufanya kazi ambayo vinginevyo haikuwa sehemu ya uwepo wake wa kawaida. Katika kesi hii, inaweza kusababisha kuongezeka kwa maambukizi na kuongezeka kwa virusi. Hii inaweza kusababisha ukuzaji wa kiumbe ambacho ni riwaya na ambacho hakikuwepo katika asili. Nia ya utafiti wa GoF ni kupata uelewa wa vibadala vya pathogenic na kuwa tayari na matibabu au chanjo, ikiwa lahaja kama hiyo itatokea kwa asili. Idadi ya mabadiliko yaliyopatikana na PPPs, sio tu hufanya aina hiyo iweze kuambukizwa kwa kiwango kikubwa lakini pia husaidia kuepuka kingamwili za kugeuza zilizoundwa dhidi ya virusi vya asili kwa watu wanaopona. Kwa kuongezea, ujanjaji wa shida unawezekana kwa kutumia mbinu za kisasa za uhandisi wa jeni kulingana na ujumuishaji unaolengwa wa RNA.⁵. Hii pia inaweza kusababisha anuwai/tatizo mpya zenye idadi kubwa ya mabadiliko, na kusababisha virusi vinavyoambukiza sana na hatari. Utafiti umeonyesha kuwa mabadiliko 20 yanayotokea kwenye protini ya spike, pamoja na mabadiliko na ufutaji, yanatosha kukwepa kingamwili nyingi zinazozalishwa kwenye plasma ya watu ambao wameambukizwa au kuchanjwa dhidi ya SARS-CoV-2.⁶. Kulingana na utafiti mwingine, chini ya shinikizo kubwa la kinga, SARS-CoV-2 inaweza kupata uwezo wa kutoroka kingamwili kwa kufanya mabadiliko 3 tu, kufutwa mara mbili kwenye kikoa cha N terminal na mutation moja (E483K) kwenye protini ya spike.⁷. 

Je, aina hii ya utafiti inapaswa kuruhusiwa ambayo inaongoza kwa uzalishaji wa PPPs? Kwa kweli, faida ya utafiti wa utendakazi ilipigwa marufuku na USA mnamo 2014 na NIH, baada ya safu ya ajali zinazohusisha vimelea visivyosimamiwa vibaya katika Vituo vya Amerika vya Kudhibiti na Kuzuia Magonjwa, na kupendekeza kwamba hatari zinazohusiana na aina hiyo ya utafiti, zinazidi sana faida ambayo inaweza kutoa. Nani anafaidika na kuibuka na kuenea kwa PPP kama hizo? Haya ni maswali magumu yanayohitaji majibu ya kweli.  

*** 

Marejeo:  

1. Kituo cha Ulaya cha Kuzuia na Kudhibiti Magonjwa. Athari za kuibuka na kuenea kwa SARSCoV-2 B.1.1. 529 lahaja ya wasiwasi (Omicron), kwa EU/EEA. 26 Novemba 2021. ECDC: Stockholm; 2021. Inapatikana mtandaoni kwa https://www.ecdc.europa.eu/en/publications-data/threat-assessment-brief-emergence-sars-cov-2-variant-b.1.1.529   

2. Simmonds P., 2020. Mabadiliko Yanayokithiri ya C→U katika Jeni za SARS-CoV-2 na Virusi vya Korona Nyingine: Sababu na Matokeo ya Mwelekeo wao wa Mageuzi wa Muda Mfupi na Mrefu. Tarehe 24 Juni 2020. DOI: https://doi.org/10.1128/mSphere.00408-20 

3. NIH. Utafiti Unaohusisha Viini Vimelea Vinavyoweza Kuimarishwa vya Gonjwa. (ukurasa ulikaguliwa Oktoba 20, 2021. https://www.nih.gov/news-events/research-involving-potential-pandemic-pathogens  

4. Mchanga unaobadilika wa utafiti wa 'faida-ya-kazi'. Asili 598, 554-557 (2021). doi: https://doi.org/10.1038/d41586-021-02903-x 

5. Bert Jan Haijema, Haukeliene Volders, na Peter JM Rottier. Kubadilisha Spishi Tropism: Njia Bora ya Kudhibiti Jeni la Virusi vya Korona. Jarida la Virology. Vol. 77, Nambari 8. DOI: https://doi.org/10.1128/JVI.77.8.4528-4538.20033 

6. Schmidt, F., Weisblum, Y., Rutkowska, M. et al. Kizuizi cha juu cha kijenetiki kwa kutoroka kwa kingamwili ya SARS-CoV-2 polyclonal neutralizing. Asili (2021). https://doi.org/10.1038/s41586-021-04005-0 

7. Andreano E., et al 2021. SARS-CoV-2 kutoroka kutoka kwa plasma ya kupona ya COVID-19 inayopunguza sana. PNAS Septemba 7, 2021 118 (36) e2103154118; https://doi.org/10.1073/pnas.2103154118 

***